灭佛政策在北齐故地的推行，遇到了比在北周旧地更强烈的阻力和反弹。北齐地区佛教信仰根基更深，许多地方豪强大族与寺院利益盘根错节，关系密切。他们或明或暗地支持僧侣进行抵抗。
在并州晋阳，一场规模不小的暴动终于爆发。当地崇福寺僧侣联合数百信徒，占据寺险，拒不从命。刺史派兵镇压，反被击退，伤亡数十人。
消息通过八百里加急传到邺城行宫时，宇文邕正在批阅奏章。他阅后震怒不已，猛地将奏折摔在案上：“岂有此理！朕已再三申明，灭佛非为迫害僧众，乃为国计民生。为何仍有这些愚民抗拒王化，自取灭亡？”
殿内群臣屏息凝神，无人敢先发声。良久，老臣元岩出于稳定考虑，谨慎地出列谏言：“陛下息怒。齐地信佛日久，情感上难以骤然接受。并州之事，或因执行过急所致。臣以为，或可稍稍放缓执行力度，以免激起更大的变乱。”
“不可！”宇文邕断然拒绝，从御座上站起，“政令已出，若朝令夕改，朝廷威信何存？今日退一尺，明日他们就要进一丈！必须加派兵力，严厉镇压，务必使诏令通行无阻！”
他看着元岩等人担忧的神情，语气稍缓：“朕知诸位爱卿担忧民生稳定。然非常之时需行非常之事。佛寺占据大量田户，僧侣不事生产，此弊不除，国无宁日。今日之痛，为的是明日之安。”
他踱步至殿中，目光扫过群臣：“传朕旨意：第一，增派两千精兵前往并州，务必平定乱事，但切记不可滥杀无辜；第二，乱平之后，当地寺院财产全部充公，僧侣一律强制还俗；第三，张贴安民告示，阐明朝廷政策，允诺还俗者授田安置。”
旨意迅速下达。半月后，并州乱平。然而在执行过程中，仍发生了令人痛心的事件：一队官兵在搜查藏匿的经像时，与信徒发生冲突，导致十余人伤亡。
消息传回，宇文邕沉默良久。是夜，他独坐案前，反复阅读并州送来的详细报告。当读到“妇孺亦有伤亡”时，他闭上双眼，手指微微颤抖。
忽然，他召来内侍：“传朕口谕：并州之事，执行官兵罚俸三月，带队将领降职一等。伤亡百姓，从朕的内帑中拨银抚恤。”
内侍惊讶地抬头，见皇帝面色凝重，不敢多问，连忙领命而去。
宇文邕独自走到窗前，望着夜空中的明月，喃喃自语：“朕非嗜杀之人。然治国如同用药，药性猛烈，方能祛除沉疴。今日之痛，他日必见其效。”
这时，宇文孝伯求见。他带来了一个消息：原北齐境内许多寺院主动上交财产，请求宽大处理。
宇文邕面色稍霁：“告诉各地官员，凡主动配合者，可酌情从宽处理。真正有德高僧，若愿还俗，可聘为学官，发挥其才。”
他停顿片刻，又补充道：“特别是那些精通医术、天文、算学者，当优先录用。佛法虽需整顿，但人才不可浪费。”
这一政策调整，很快产生了效果。抵抗情绪逐渐缓和，灭佛运动得以在北齐故地继续推行下去。然而宇文邕知道，这场变革的阵痛，还远未结束。