西南地区有四川、云南、贵州、重庆、广西西部以及西藏东部等，众多的少数民族聚集地。
汉昭帝元年，西南地区二十四邑夷民反汉。汉昭帝派遣水衡都尉吕破胡率军平叛，迅速将叛乱平息。
始元四年，再次起兵反抗。这一次吕破胡行动迟缓，致使益州太守被杀，还死伤了四千多人。
随后西汉又派出王平、田广明领大军出征，还调句町侯毋波的亲兵武装配合，捕斩夷民三万余人，虏获牲畜五万余头。从此稳定达五十余年，句町侯毋波也因功劳被封为句町王。
明朝洪武十四年，朱元璋派出傅友德、蓝玉等人率领大军南征云南，顺利平定云南，并将其纳入明朝版图。
到了万历时期，明朝在西南地区实行土司制度，以至于土司势力逐渐膨胀，出现了叛乱的情况。
到了清朝乾隆时期，西南地区的土司制度下，大小金川地区的土司势力不断壮大。
大金川土司莎罗奔在乾隆十一年（1746 年）凭借武力夺取小金川土司泽旺的印信，并攻击明正土司，严重破坏了西南边疆的稳定。
莎罗奔是金川地区土目嘉勒塔尔巴的庶孙，在康熙六十年，莎罗奔被委以副长官司职衔，管理大金川驻牧事务。雍正元年，莎罗奔被授大金川安抚司职衔。他通过政治联姻，将女儿分别嫁给小金川土司泽旺和巴底土司纳旺，以此巩固自己的势力。
莎罗奔攻占明正土司的鲁密章谷是内地通往西藏、青海、甘肃等藏族地区的咽喉与桥梁地带，战略位置极为重要。
这里还是贸易往来的重要通道，掌控着丰富的物资流通资源。莎罗奔的这些行为严重威胁到了清朝的统治和西南地区的稳定，因此清朝政府决定对他进行清算。
乾隆十二年，清廷出兵征讨大金川。莎罗奔率藏族兵民，凭借当地易守难攻的地形和坚固的碉楼，奋勇反击，凭险抵抗。清军久战不进，先后派去的纪山、张广泗、讷亲等将领率领的军队都未能取得胜利。
乾隆十四年，清廷再遣傅恒及岳钟琪前往督师，双方仍相持不下。由于岳钟琪与莎罗奔曾有旧交，在岳钟琪的劝说下，莎罗奔最终在其营中投降，发誓不再反叛。乾隆帝为笼络人心，下诏赦免了莎罗奔的罪行，仍让他担任土司一职。此后，因年老，莎罗奔由侄郎卡主土司事。
乾隆三十一年（1766 年），清廷派四川总督阿尔泰联合九家土司合攻大金川，小金川土司僧格桑却与大金川土司索诺木联合反清，阿尔泰调解无果。到乾隆三十五年（1770 年），大小金川冲突不断。乾隆三十六年（1771 年），清朝政府向金川进兵。
第二次金川之役开始。同年董天弼和阿尔泰被革职。次年，桂林率军攻击木城受挫，参将薛琮部被包围，桂林没有驰援，致参将薛琮以下三十余人阵亡。乾隆三十八年（1773 年），温福战死。
随后，乾隆派阿桂为定西将军，增兵金川。经过多次血战，清军于乾隆四十一年（1776 年）初取胜，历时五年、死伤逾万人、耗银七千万两的第二次金川之役至此结束。
大小金川地区的男子普遍勇猛，自小习武，12 岁以后的男子个个善武，擅长击刺之术，背二三十斤重物登山越岭如履平地，作战时以家庭为战斗单位，父子兄弟一起上阵，具有非常强大的凝聚力，一旦发动进攻都是一拥而上，绝不怕死，在战斗中常常能以十数人胜百人，让清军望风而逃。
当地修筑了大量坚固的碉楼，易守难攻。清军进攻时步步仰攻，殊为费力，而且越靠近对方越难以进攻。
虽然土地贫瘠，但大金川土司莎罗奔对内休养生息，开疆种地，有一定的经济基础来维持军事行动等。并且大小金川所在的嘉绒藏区东连成都，西连西藏，北连西宁、青海，南连云南、贵州，是西南经济的生命线，内地的粮食物资、藏区的茶马贸易等都需要经过此地区，在经济贸易上具有重要的战略地位。
清朝对土司地区的贸易往来进行严格的限制等政策，触及了土司的经济利益，在一定程度上激化了矛盾。土司们认为自身利益受损，对清朝的统治产生不满和反抗情绪。
大小金川土司随着自身实力的增强，野心不断膨胀，开始不断扩张领土，试图扩大自己的势力范围，不再满足于原有的统治格局，想要获取更大的权力和利益，逐渐脱离了朝廷的掌控。
嘉绒地区在历史演变过程中，形成了自己独特的文化和社会结构，土司在当地具有较高的威望和统治基础。长期以来的土司制度使得他们在地方上拥有较大的自主权，对中央政府的统治存在一定的抵触情绪，从心理上不愿意接受中央的过多干涉。
大小金川地区的土司为了获取更多的土地、人口和资源，不断进行势力扩张。大金川土司莎罗奔在乾隆十年（1745 年）袭击小金川，夺取了小金川土司泽旺的印信；乾隆十二年（1747 年），莎罗奔又出兵攻打革布什乃及明正土司等周边土司。这种频繁的武力扩张行为，严重破坏了当地的政治秩序，对清朝在西南地区的统治构成了直接威胁。
土司在其辖区内拥有至高无上的权力，如同“土皇帝”一般，一切山川、河流、土地、牧场等都归其所有，对境内的农奴甚至有生杀予夺之权。这种高度的自治和独立性，使得土司们容易形成尾大不掉之势，逐渐脱离中央政府的管控。
大小金川位于今四川省西部，是内地通往西藏、青海等地区的纽带和咽喉。其地理位置十分关键，一旦土司叛乱势力坐大，不仅会阻断内地与藏区的联系，还可能影响到整个西南边疆的稳定，对于清朝的国家统一和领土完整具有重要的战略意义。
如果清政府不能及时有效地镇压大小金川的叛乱，其他土司可能会纷纷效仿，导致西南地区的局势更加动荡不安，这将对清朝的统治造成更大的冲击。
乾隆皇帝作为封建王朝的最高统治者，十分重视国家的统一和“国体”的尊严。大小金川土司的叛乱行为是对清朝中央权威的挑战，若不加以严厉惩治，难以彰显皇威，也无法维护国家的统一和尊严。
小金川地处川西嘉绒藏族地区，西连甘孜藏族自治州，东连成都平原进入川西汶川县，南接雅安地区，北接川西高原，是内地通往西藏、青海、甘肃等藏族地区的咽喉与桥梁地带，地理位置和战略地位极为重要，现在位于四川省阿坝藏族羌族自治州的金川县和小金县。这两次平叛战争持续时间长，战况惨烈，被列为乾隆帝的“十全武功”之二，对维护西南边疆稳定起到了重要作用。
乾隆平定西南后，朝廷派傅恒、阿桂等官员治理。他们使西南地区社会稳定，叛乱平息，百姓安居。
贸易繁荣，茶叶、药材、木材等特色物产大量运往内地，内地的丝绸、瓷器、铁器等商品也流入西南。
云南的普洱茶深受内地消费者喜爱，成为重要的贸易商品。西南地区的矿产资源得到开发，如铜矿、铁矿等，促进了当地手工业和制造业的发展。
建设兴修水利，改善灌溉条件，提高农业产量，保障百姓粮食供应。还修缮道路和桥梁，加强了西南地区与内地的联系，促进了贸易往来和人员流动。在一些重要城市和战略要地修建城墙和军事设施，增强了地方的防御能力。
尊重少数民族风俗习惯和宗教信仰，促进了各民族和谐共处。
新中国成立初期，第二野战军解放四川、贵州、云南、西康四省。但随后匪患严重，西南军区展开剿匪行动。
第一阶段进剿大股土匪，四川驻川部队肃清重要交通线及富庶地区匪患后逐步扩展；贵州军区确定剿匪策略，调入其他部队参与剿匪；云南军区成立剿匪委员会，对多地股匪重点围剿；西康解放军打击围攻县城的土匪后分区清剿。
第二阶段清剿残匪，西南军区依靠各族人民，肃清分散隐蔽且混入基层政权和群众团体、挑拨民族关系的残匪。最终，西南地区军民取得剿匪胜利，社会秩序恢复，经济恢复工作得以顺利进行。