寻常兵刃难伤鬼魅，蚩尤大军又各个骁勇善战，黄帝大军此刻就好比刚刚清除完自己身上的负面状态，对面蚩尤大军早就领先三级外加一件装备，硬碰硬黄帝大军任然不是蚩尤大军的对手。
为了战胜蚩尤，九天玄女又为黄帝制作夔(音葵)牛皮巨鼓八十面，又再授予黄帝图策, 印剑之物，以战备之用，黄帝在得到九天玄女辅助之后，带兵与蚩尤大战于中冀。当黄帝摆下“奇门遁甲”阵之后，即令军士以雷兽之骨，大击八十面夔牛皮巨鼓，一时鼓声大作, 一击震五百里, 连击震三千八里, 只见整个战场地动山摇，天旋地转，喊杀冲宵汉，使量蚩尤兵卒神魂颠倒，冲杀元门，败倒如山。“
蚩尤带着自己的残部往西南方向逃跑。黄帝紧追不舍，最后终于在今天山西解州的地方，包围了蚩尤的军队。但是蚩尤力大无比，武功高强，尤做困兽之斗。九天玄女祭起五岳真形箓，把蚩尤给紧紧的困住了。黄帝的将兵们一拥而上，拿刀斧砍尤的头，但是头刚被砍下来，又长出一颗。
原来蚩尤乃盘古真身，兽身人语，铜头铁额, 食沙石子即可涉及盘古精气，本身即为不死之身，盘古不灭蚩尤不死，可这盘古早就化身天地，盘古灭等于天地绝，谁这个本事能把天地灭绝。在这盘古所化天地之内蚩尤妥妥不死不灭的存在，任凭黄帝使出浑身解数都无法将蚩尤彻底消灭，很快黄帝就想到了妖族，想要彻底杀死蚩尤还有另一种办法, 那就是妖族出手，妖族与巫族斗了这么久对彼此了如指掌, 定有办法消灭蚩尤。
黄帝只得再次向女天玄女求助, 可这次九天玄女说什么也不肯帮忙，来之前西王母就告诉九天玄女，帮助黄帝不可超过五次, 而且逗留时间不能太久, 巫族那边烛九阴照彻古今, 现在虽被妖师鲲鹏用周天大阵困住，但用不了多久烛九阴就能突破封锁, 只要烛九阴脱困传出消息, 巫族那边就会通过烛九阴被周天大阵蒙蔽
一事联想到咱们出手帮助黄帝。
周天大阵蒙蔽天机, 干扰烛九阴照彻古今也有一个上限, 那只能是五次，超过五次就会被烛九阴发现端倪，到时候烛九阴肯定会拼死破阵，妖族计划败露巫族定不会善罢甘休，说不定十二巫祖会亲自下场，到时候人族这颗棋子很可能被巫族抹杀，进而引发巫妖大战的决战。
九天玄女知晓事情严重性，一直牢记西王母的话，任黄帝心急如焚，而九天玄女说什么也不肯再出手。黄帝是个心思缜密之人，见九天玄女似有难言之隐，便向其询问缘由，不帮忙不要紧，那终归得有个理由，无奈之下九天玄女只好如实相告。
黄帝听后稍作沉思，计上心头。
向九天询问，有什么办法是不用九天玄女亲自动手，由他动手就能灭杀蚩尤的办法！
九天玄女点点头。
随后黄帝又问这个办法是否很难，他能不能当场掌握。
九天玄女再次点点头。
黄帝见状脸上立刻露出狡黠笑容，向九天玄女说：“现在我拜你为师，你把那个办法传给你徒弟，那就不算帮我了！”
九天玄女听后顿时大为纠结，黄帝说的这个取巧的法子看上去十分可行，但此事关乎妖族安危，九天玄女不敢轻易冒险。
正纠结之际，黄帝纳头便拜，没等就九天玄女反应过来，黄帝三个响头已经叩完，直接让九天玄女哑口无言，黄帝好歹也是人族之主，人皇一拜天地为鉴，此时她要是拒绝日后必定承担极大因果，心中只叹这黄帝太过狡猾。
玄女也只能收黄帝为徒，匆匆传下一段咒语之后，立刻飘然离去向西王母禀告此事。黄帝得神咒大喜，亲自提剑，念动咒语，只见剑锋闪处，蚩尤的头早已落在地上。这次蚩尤没有长出新的脑袋，可新的麻烦却出现了。
蚩尤的头跟铜铸的一样硬，怎么也毁不掉。尸首分离还能在地上眨巴眼，身体竟然挣扎着想要去捡自己的脑袋，黄帝见状立刻命人看住蚩尤身体，挥剑便砍蚩尤脑袋，情急之下黄帝忘了念九天玄女传授的神咒，一剑劈下去只听一阵金石交错之音，蚩尤脑袋竟被劈飞出去，蚩尤脑袋竟然就这样飞走了，黄帝连忙追上去，这蚩尤脑袋不仅会飞，在悬崖峭壁上如走平地，黄帝怎么也捉不住他。追到冀州中部时，黄帝灵感突现，命人把夔牛皮鼓使劲连擂九下，这一下，蚩尤顿时魂丧魄散，不能行走，被黄帝捉住了。
回到大军驻地，蚩尤尸体被枷锁牢牢绑住挣扎不止，黄帝顿时犯了难，蚩尤虽然没了脑袋，身体却依旧能作怪，实在没办法，黄帝只能再次念神咒将蚩尤身体大卸八块。
可即便如此被分尸的各处肢体依旧能自由活动，手脚乱跑，还会出手伤人。
这下黄帝彻底没辙为了以绝后患再次祷告天地向妖族求助，这时九天玄女已经返回天庭，将取巧帮助黄帝之事告诉西王母等人，既然现在早已破了五次之界，妖族一方索性破罐破摔，无所谓多出手一次，这一次帝俊等人齐上阵大家一起催动星辰幡，用周天大阵遮蔽住大荒天机，然后派人将蚩尤尸块分别藏于五极之中封存，五极为天庭，地下，人间，北极，南极。其中地下和人间有一个可能是指蚩尤肩髀冢。
蚩尤一死巫族立刻成了一盘散沙，溃不成军纷纷四散而逃。黄帝见状又挥师南下杀夸父等大巫，巫族彻底大败，黄帝遂威震天下，为天下主。
等十二祖巫突破妖族封锁，才发现不死之身的兵主蚩尤死了，烛九阴照遍九天十地也找不到蚩尤尸体何在，找来找去只找到蚩尤血迹，他身上的枷栲才被取下来抛掷在荒山上，变成了一片枫树林，那每一片枫叶，都是蚩尤枷栲上的斑斑血迹。