随着大和号战列舰彻底沉没，整个太平洋共和国海军舰队的第一攻击波的攻击全部结束，第一攻击波的攻击实质上并没有对联合舰队造成非常重大的毁灭性的攻击，因为第一攻击波实际上只继承了大和号战列舰，一艘战列舰以及两艘重型巡洋舰，还有六艘左右的驱逐舰，并没有对航空母舰编队造成任何打击。
实际上这也是因为整个太平洋共和国海军航空母舰编队的策略调整造成的，实际上在日本联合舰队集合的过程当中，太平洋共和国已经得知了日本联合舰队所拥有的实际军舰数量以及各行军舰的相关技术指标，在这种情况之下，太平洋共和国海军舰队希望能够全歼日本联合舰队，这样的话就必须要首先清除掉日本联合舰队可能的防空主力战舰，以大和号武藏号为核心的八艘战列舰，就是日本联合舰队的肉盾，必须先把这些肉盾去除掉，才能够放心的打击日本联合舰队保存在这些肉盾后方的真正的战斗力。
下午1:03，第一攻击波的大部分战机已经返回太平洋共和国的航空母舰准备整补，而第二攻击不早，在12:25就已经起飞了。
与此同时，在第一攻击波和第二攻击波交错的过程当中，日本联合舰队也进行了紧急调整，日本联合舰队最高司令官小泽治三郎下达了命令，要求联合舰队抛弃掉那些已经没有任何作战能力的战舰，所有的战舰开始尽速向最近的方向靠拢，想要能够得到日本陆基航空兵的援助，并且小泽治三郎下达了命令，要求日本联合舰队的四艘航空母舰全部起飞舰载机。
小泽治三郎的这一系列的命令，已经很明显的暴露了日本联合舰队的作战方针，他们并没有想要和太平洋共和国海军航空母舰编队进行这样的决战，在力量上处于下风，而且又遭到太平洋共和国海军航空母舰编队突然打击的情况之下，日本联合舰队是不可能获得胜利的，小泽治三郎和日本联合舰队的高级参谋们，对此非常清楚，所以他们决定退避三舍。
但是日本联合舰队想撤退，也要看太平洋共和国海军航空母舰编队让不让他们撤退。第二攻击波从12:25起飞之后，于下午的2:03抵达了日本联合舰队上空。
此时的联合舰队已经距离日本本土不远了。联合舰队也依靠剩余的战舰组成了庞大的轮式防空圈，希望能够就此阻击太平洋共和国的航空攻击。
为了这一次组建日本联合舰队做了充分的准备，联合舰队的剩余七艘战列舰组成了庞大的外围防御军团，他们依靠自身巨大的吨位以及上面近百的防空火力，对日本联合舰队进行第一层次的保护，他们主要的目标是机会来自太平洋共和国航空母舰编队的战斗机，并且最大程度的避免俯冲轰炸机冲过他们的防线。
第二道防线则是以重型巡洋舰为核心的，他们相继的够住了几个独立的相系隔离的。防空据点，这些防空据点可以最大程度上面限制，太平洋共和国航空母舰编队起飞的舰载机对日本联合舰队重要战斗能力的攻击。
最后一道防线则是以日本联合舰队的四艘舰队航空母舰为核心的四艘舰队航空母舰，为了聚集了护航航空母舰以及其他的防空驱逐舰，这些辅助性的舰只，可以让日本联合舰队的航空母舰编队受到最大程度的保护。
不过这样的防御到底能不能起作用，还需要等待事实的检验，事实上太平洋共和国航空母舰编队的第二攻击波对日本联合舰队的打击是异乎寻常的坚决了他们这一次准备的攻击方式跟上一次的攻击方式完全一致，首先解决掉日本强大的战列舰编队。
在这样的战术思路指导之下，太平洋共和国航空母舰编队的舰载机首先对日本联合舰队的另外几艘大型战列舰武藏号爱宕号展开了全面的攻击。
截止到下午2:03，仅仅发动了半个小时的攻击武藏号，战列舰就已经身中六枚鱼雷，并且遭到12枚航空炸弹的攻击。
这样的攻击力度令人震惊，但是也充分体现出了现在日本联合舰队的虚弱现状，日本联合舰队的航空母舰虽然起飞了舰载机，但是这些舰载机飞行员已经远远没有之前日本航空母舰编队上的精锐飞行员那样的作战实力，他们根本无法应对现在太平洋共和国航空母舰编队的攻击。
也无法阻止太平洋共和国航空母舰编队上面，舰载机飞行员对日本联合舰队各种战舰的打击。
下午3:03，日本联合舰队的另外两艘战列舰，在遭到了大量的鱼雷和航空炸弹攻击之后，也宣布无法继续维持而沉默，至此，日本联合舰队的八艘战列舰已经有四艘被彻底击沉。
在这种情况之下，日本联合舰队的司令官小泽治三郎显得非常紧张，他一方面在向日本本土紧急报告现在的情况，另外一方面则要求自己现在的舰队不惜一切代价撤退，首先要保证航空母舰的撤退。
但是摆在小泽治三郎面前的问题在于，航空母舰可以撤退是可以撤退，但是一旦航空母舰脱离出了现在日本联合舰队由战列舰和重型巡洋舰组成的防空火力网，那么很显然他们就会立即遭到太平洋共和国舰队的攻击。
在这样的情况之下，航空母舰即便有几艘巡洋舰或者驱逐舰掩护又能怎么样呢？在如此庞大的防空火力网掩护之下都无法保存的航空母舰，一旦脱离了该防空火力网，一定会被击沉的。
这样的现状，让小泽治三郎为首的日本联合舰队的高级军官们显得非常的无奈他们在苦苦地一边指挥着防空作战，另外一方面则思考的舰队如何才能够脱困。
而在另外一方面，太平洋共和国的海军舰队现在就比较轻松了，他们只需要等待航空编队摧毁了日本联合舰队的战列舰之后对剩下的战舰逐一击破就可以了！