到了第二天，水奈早早的就站在外面等候。不多时，洋介和灵子夫妇就出现在她面前。
“爸爸！妈妈！”水奈冲过去，一家人抱成一团。
洋介轻轻拍着女儿的背，笑道：“我们先去把东西放回家里，就一起去找大木博士吧。”
水奈点点头：“嗯！”
一行人朝家走去。听到动静的小智、小刚和小霞也出来看。
小智大大方方地打招呼：“洋介叔叔，灵子阿姨，好久不见了！”
洋介笑道：“好久不见啊，小智。麻烦你一直照顾我们家小水奈了。”
水奈有些不服道：“爸爸！明明是我一直在照顾他好不好！”
洋介看着女儿气鼓鼓的样子，哈哈大笑起来。
小霞和小刚也走上前来打招呼。
小刚激动得语无伦次，对着灵子说道：“灵、灵子女士！您是我的偶像！是我励志成为世界第一培育家的终极目标啊！如果可以的话，希望灵子女士能指点一下我！”
灵子看着小刚狂热的样子，笑了笑道：“当然没问题。”
一行人进到屋内，洋介看着窗明几净的房间，感叹道：“好久没回来了，还真是干净啊。”
水奈表示：“这是大家昨天一起打扫的成果。”
灵子温柔地看着众人：“辛苦大家了。今天就在我家吃吧，我做顿大餐好好犒劳一下大家。”
“太好了！”众人一阵欢呼。
这时，花子阿姨带着吸盘魔偶，端着一盘点心走过来：“做了一点点心，大家都吃点吧。灵子，洋介，欢迎回来。”
一行人稍作休息后，就去往了大木博士研究所。
一见到大木博士，小智就迫不及待地问：“博士！联盟大会什么时候开始啊？”
大木博士思索一番，道：“好像还有一两个月来着。你们可以不这么急，好好在家休息。”
小智有些丧气：“什么嘛，还要这么久……水奈，你准备干什么啊？”
水奈表示：“这段时间内我要特训，并且让丑丑鱼进化。”
小智一听这话，也斗志满满：“好！那我也要开始特训！”
就这样，众人开始了在真新镇的特训日子。水奈请求母亲灵子帮她制作能提高丑丑鱼美丽度的能量方块，她要为丑丑鱼进化成美纳斯做准备。
就这样过了大概两周左右，在水奈的精心培育和灵子特制能量方块的帮助下，丑丑鱼周身绽放出耀眼的进化之光，正式进化为姿态优雅、美丽动人的美纳斯！
小霞看着美纳斯那华美的样子，惊讶地赞叹道：“好美啊！要是我也有一只美纳斯就好了！”
又过了几天，众人正在特训中，没想到突然来了两位来客。正是水奈的外公——天海刚，以及外婆——天海静流。
小霞好奇地看着这两位气质不凡的老人。小刚则是目瞪口呆。
小霞不解地问：“小刚，你怎么了？”
小刚压低声音，激动地表示：“你不觉得这二位看起来很眼熟吗？”
小霞还是一脸疑惑。
小刚解释道：“水奈的外婆是城都地区的水系天王啊！还有之前我给你看彩虹市地下黑市被剿灭的新闻，就是水奈外公带队的！”
小霞这才反应过来，目瞪口呆。
水奈看见两人，惊喜地冲过去抱住外婆：“外婆！外公！你们怎么来了！”
天海刚笑着解释道：“你外婆休假了，我也就陪着她一起请假来看看你。刚好，你外婆也想看看你的‘小男朋友’呢。”
水奈瞬间羞红了脸，跺脚道：“外公！我都跟你说了不是男朋友呀！”
天海刚哈哈大笑：“这小子当时可是信誓旦旦的跟我说会照顾好你！”
眼看小霞和小刚都露出一副吃瓜的表情，水奈羞恼地喊道：“外公！”
天海刚哈哈大笑道：“好了好了，不逗你了。你外婆知道你在特训，所以我们就来陪你一起特训，有什么不懂的也方便问我们。”
就这样，特训的日子又进入了新的阶段。外婆静流亲自指导水奈进行水系宝可梦的特训，天海刚则是应小智的请求，对他展开特训。连大木博士也凑热闹，来给小智传授了迷你龙的培育方法。
日子就这样在充实中慢慢过去。突然有一天，一只邮递员打扮的快龙飞过来，掏出一封信递给小智和水奈。
信上写着：「请原谅我冒昧给你来信。你们几位被认为是最具潜力的宝可梦训练家，所以想邀请各位参加我主人举办的“最强宝可梦训练家派对”。地点是 新岛-宝可梦城。不知各位是否愿意前来？请在明信片上打勾。这是最强宝可梦训练家的邀请，请您务必参加。」
众人面面相觑。
小智激动地表示：“去参加吧！我们应该参加的！”
小霞道：“他说我们有前途，听起来很不错。”
水奈点点头：“那就在明信片的‘Yes’这里打勾。”
打完勾之后，两人将明信片还给快龙，快龙再次飞走了。
小智一行人简单收拾了一下，并跟家长们说明情况后，就动身前往新岛。要前往新岛，需要在一处港口坐渡轮。小智一行人正慢悠悠走着，没想到天空骤然变色，开始下起暴风雨。他们急忙朝附近的宝可梦中心跑去。
宝可梦中心里挤满了躲雨的训练家，大部分人都把自己的宝可梦放出来喂食。君莎小姐走过来对着众人道：“各位，渡船停航了。”
众人顿时七嘴八舌地议论起来，有惋惜的，有愤怒的。
君莎小姐让大家安静下来，并指了指旁边一位蓝色波浪卷发的女士道：“这位是港口的负责人，波依嘉小姐。”
负责人波依嘉缓缓开口道：“我是波依嘉。想了解海洋的情况，就去听听海浪的声音吧……不过，也不需要去听了。你们看，这么阴沉的天，这样的飓风还从没有见过。”
君莎小姐问：“真的这么严重吗？”
波依嘉点点头，郑重道：“从小生长在港口的我，也从未见过如此强烈的暴风雨。而且这场暴风雨正盘旋在新岛的上空。我绝不能让你们去冒生命危险，这是我身为港口守护者的请求。”
君莎小姐向众人宣布：“因此，渡船要停航。”
这时候，人群中一个壮汉道：“不要紧！我的宝可梦的话……我的宝可梦水性很好，一定可以穿过这片海洋的！”
波依嘉道：“请等一下！连最了解海洋的我都说不行！”
君莎小姐附和道：“没错！而且如果现在宝可梦受伤的话，也无法在宝可梦中心接受治疗！”
小智这时候终于挤到前面，连忙询问君莎小姐：“君莎小姐，这是怎么一回事？”
君莎小姐表示：“宝可梦中心的乔伊小姐失踪了！乔伊小姐不在，是无法对宝可梦进行治疗的。那边的海报就是寻人启事。”
小刚走过去看了看寻人启事，感叹道：“真漂亮啊……”
而这时候，一些按捺不住的训练家已经召唤出宝可梦冲了出去。有人骑着比雕飞走，有人骑着暴鲤龙和白海狮从海上过去。
君莎小姐冲出去道：“不要这样！不然我要逮捕你们了！”强大的暴风吹走了她的帽子。
波依嘉站在君莎身后，看着那些远去的身影，道：“果然阻止也没用……他们是宝可梦训练家，是一群冒险者。如果阻止得了，也不会聚集在这里了。”
君莎小姐叹了口气：“希望他们平安无事……”
小智一行人也冲了出来，站在港口。
小智看着波涛汹涌的大海，坚定道：“在海的另一边，有最强的训练家！不能就这样退缩！我们走吧！”
众人点点头。
小霞派出了暴鲤龙：“我和小刚一起。水奈，你和小智一起吧。”
水奈点点头，派出了刚刚进化、显得神圣而美丽的美纳斯。
几人骑上宝可梦，也向着新岛的方向，毅然冲入了暴风雨之中。