星舰降落在星际联盟停机坪时，地球的生态已恢复到暗源危机前的模样——曾经被污染的森林重新长出翠绿的枝叶，干涸的湖泊蓄满清澈的湖水，连空气中都带着花草的清香。孩子们在停机坪旁的草地上追逐嬉戏，看到星舰归来，立刻围了上来，举着画满宇宙冒险的涂鸦，叽叽喳喳地询问新的故事。
“混沌星域？光与影的交界处？”联盟首领听完文茜的讲述，手指在桌面上轻轻敲击，眼中满是凝重，“三个月后的星核共振日，我们会全力支持你们。联盟的工程师可以协助检修星舰，物资储备也会按最高标准准备。”
接下来的日子里，所有人都投入到紧张的备战中。埃伦带领联盟工程师拆解星舰引擎，用起源星域带回的金色晶体改造动力系统，让星舰能承受时空乱流的冲击；凯和莉娅则忙着升级武器，将暗源转化炮与星核能量结合，研发出能同时释放光与影能量的“双生炮”；玥和马库斯泡在联盟的资料库，将起源文明的古籍与观测站获取的星图对比，标注出混沌星域可能存在的危险区域。
文茜则每天带着星核晶体前往九颗星核枢纽的地球分支点，感受能量流动的规律。在一次触摸枢纽能量核心时，她突然看到一段模糊的画面——画面中，混沌星域的中心悬浮着一颗黑白交织的球体，周围环绕着无数时空乱流，而起源文明的飞船在乱流中破碎，化作宇宙尘埃。
“混沌之心比我们想象的更危险。”文茜将画面记录下来，带回联盟给众人看，“起源文明的失败说明，单纯依靠星核能量无法靠近它，我们需要找到能平衡时空乱流的方法。”
马库斯翻遍古籍，终于在一页残破的书页上找到线索：“这里提到‘星核共鸣阵’——将九颗星核枢纽的能量通过星核晶体汇聚，能在星舰周围形成一道‘时空屏障’，抵御乱流的冲击。但启动阵法需要九个人同时注入精神力，少一个都不行。”
“我们刚好九个人！”莉娅突然拍手，“我、文茜、凯、埃伦、玥、马库斯，再加上联盟的三位工程师，刚好能组成共鸣阵！”
众人立刻开始演练。每天清晨，他们围坐在星核晶体旁，将手放在晶体上，尝试同步精神力。起初，能量总是相互冲突，星核晶体的光芒忽明忽暗；但随着练习次数增多，九道精神力渐渐融合，晶体最终爆发出稳定的白光，在周围形成一道淡蓝色的屏障。
距离星核共振日还有三天时，意外突然发生。玥在监测星核枢纽能量时，发现其中一颗枢纽的能量波动异常：“北极枢纽的能量在快速减弱，好像有东西在吸收能量！”
文茜立刻带领凯和莉娅前往北极。当他们抵达枢纽所在的冰川时，看到一艘破损的暗源战舰正停靠在枢纽旁，舰体上的暗紫色纹路正不断吸食枢纽的能量，而战舰的驾驶舱里，坐着一个熟悉的身影——曾经在黑洞星域逃脱的暗源指挥官。
“又是你！”莉娅举起双生炮，炮口对准战舰，“上次让你跑了，这次别想再逃！”
暗源指挥官冷笑一声，按下操控台的按钮，战舰突然释放出一道黑色能量罩，将枢纽包裹其中：“我不需要逃。只要吸收完这颗枢纽的能量，混沌星域的时空乱流就会提前爆发，你们永远别想到达那里！”
文茜握紧星核晶体，将能量注入枢纽：“凯，用双生炮攻击能量罩的薄弱点！莉娅，掩护他！”
凯立刻调整炮口，白色的光能量凝聚在炮口，狠狠击中能量罩的缝隙处。能量罩出现一道裂痕，莉娅趁机发射暗能量炮弹，将裂痕扩大。文茜抓住机会，将星核晶体贴在枢纽上，枢纽瞬间爆发出强光，冲破能量罩，将暗源战舰弹飞。
暗源指挥官见计划失败，驾驶战舰朝着宇宙深处逃窜。凯想追击，却被文茜拦住：“别追了，枢纽的能量需要时间恢复，我们不能因小失大。”
回到联盟后，众人立刻全力修复北极枢纽的能量。在星核晶体的加持下，枢纽终于在星核共振日前一天恢复正常。
共振日当天，星舰停在地球轨道上，九颗星核枢纽同时发出金色的光芒，在宇宙中形成一道光柱，指引着混沌星域的方向。文茜带领众人围坐在星核晶体旁，双手放在晶体上，同步注入精神力。
“星核共鸣阵，启动！”
随着文茜的声音落下，星核晶体爆发出耀眼的白光，九道能量线从晶体延伸到星舰各处，最终在舰体外形成一道厚厚的时空屏障。埃伦启动引擎，星舰朝着光柱指引的方向飞去，穿过大气层，进入宇宙。
舷窗外，九颗星核枢纽的光芒越来越亮，最终汇聚成一道通往混沌星域的能量通道。文茜看着通道尽头的黑暗，握紧了身边凯的手——那里是危机的源头，也是守护宇宙平衡的最后希望。
星舰加速驶入能量通道，周围的时空开始扭曲，金色的光芒与黑色的乱流交织。但在时空屏障的保护下，星舰平稳前行，朝着混沌星域的方向，一步步靠近那颗黑白交织的混沌之心。
决战的序幕，终于拉开。