青牛村后山药园在谷雨时节突发异变。那株三百年药龄的紫参王无风自动，参须如活物般蠕动，在晨露中渗出暗红汁液。刘镇南盯着参叶上新生的纹路，发现这些纹路竟在晨曦下组成诡异的符文。
新任药阁执事踏着药雾降临，手中药锄轻挥间，整片药田的草木瞬间枯萎。山野采药人，也配培育灵药？锄风过处，地裂缝中钻出药宗用毒瘴炼制的蚀元蛊。刘镇南临危不乱，引山泉化雨，水珠触及毒蛊竟凝成翡翠色的净灵液。
月圆之夜，真正的危机降临。药阁长老撕裂虚空，袖中飞出的药种落地即成妖植。老药师惊恐地发现，自己培育十年的七星草竟在土中异变，草叶边缘生出锯齿，正悄然缠向熟睡的村民。
镇南哥，药园里的泥土在吃人！林素衣提着药篮踉跄跑来，篮中草药沾满露水。她指着药田，只见泥土如活物般蠕动，几个村民的小腿已被吞没。
七日恶战，刘镇南以心血浇灌灵药。朦胧中见林素衣残魂显现，将毕生所学凝成《百草真解》。可就在这时，药阁之主真身降临，他脚踏毒龙，腰间摄魂鼎摇出惑心魔音。
关键时刻，刘镇南在药液倒影中窥见恐怖真相。每株灵药都连着村民的经脉，药力的另一端没入地心深处的药灵核。核中镇压着上古凶药噬心散，正在通过药力吞噬生灵精气。
刘镇南咬破指尖，将血滴入药灵核。血染灵核的刹那，凶药发出刺耳尖鸣。那些连接村民的药力丝线纷纷断裂，但垂死的凶药突然自爆，毒雾如潮水涌来。
眼看毒雾就要湮灭村庄，林素衣残魂彻底燃烧，化作光罩护住天地。毒雾触及光罩竟化作滋养万物的灵气，原来她早已将本命药灵炼成了净世明灯。
寒露深夜，当最后一道药毒消散时，药园中升起一尊白玉药鼎。鼎身天然生长着《万药归宗图》，更神奇的是，此鼎能自动净化毒性，炼制出的丹药都带着纯净药性。
立春那日，药鼎突然无火自沸。鼎中自发炼出一炉造化丹，丹药表面浮现龙凤道纹。村民们发现，此丹可治百病，连垂死的古树都能重焕生机。
然而这种神效引来了海外药修的觊觎。三大药师联手布下蚀元大阵，大阵运转时，村民发现自己炼制的丹药竟在反噬其主。
危急时刻，老药师在古籍中发现破阵之法。但当刘镇南集齐解药所需的三样灵物时，药阁余孽突然现身抢夺。
就在灵物即将被夺的刹那，林素衣残魂与药鼎产生共鸣。药鼎突然化作百丈巨鼎，鼎中飞出的药灵如雨点般洒落。更神奇的是，这些药灵能辨善恶，只救治心怀善念之人。
但胜利的代价是药鼎灵性大损，鼎身出现裂痕。就在众人绝望之际，鼎中突然飞出一对药灵，药灵吐出的药气竟在自动修复药鼎。
新春伊始，当第一缕阳光照进药园时，修复完成的药鼎已焕然一新。更令人惊喜的是，鼎中孕育出的新丹药，都带着净化万毒的特性。
雨水时节，两个药童在园中玩耍时，无意间将废丹投入古井。井水突然沸腾，水中浮现出完整的《丹药真解》。饮过井水的村民，竟能辨识药性，甚至能自行配方治病。
惊蛰春雷中，当外敌来袭时，这口古井突然涌出甘泉，泉水在空中结成防护大阵。来犯者陷入阵中，竟被水幕所困。
从此，青牛村成了药修圣地，而刘镇南也明白，真正的药道不在炼丹，而在医心。这段凡心炼药，真情成丹的佳话，随着春风传遍三界。
谷雨绵绵中，异变再生。那些被治愈的村民突然开始吐出黑色药渣，周身浮现诡异药纹。原来药阁之主临死前，在所有服用过丹药的村民体内种下了噬主药蛊。
小满午夜，更大的危机降临。噬主药蛊突然集体暴走，村民一个接一个倒下，他们的本命精元正被药蛊疯狂吞噬。
芒种黎明，刘镇南在古籍残页中找到一线生机。他以自身为药鼎，将暴走的药蛊引入体内。在生死关头，林素衣残魂与他的本命药灵完美融合，竟在体内炼成了亘古未有的。
夏至时分，当情丹成形的刹那，所有药蛊突然温顺如绵羊。原来情丹能化解世间万毒，更是所有药蛊的克星。药蛊在情丹的影响下，反而成了滋补村民的灵药。
从此，青牛村成了真正的药道圣地，而刘镇南与林素衣的故事，也随着这尊神奇药鼎的传说，在天地间永恒流传。
多年以后，当刘镇南站在重生的药园前，看着园中欣欣向荣的灵药，他终于明白：真正的药师，不是能炼制多少灵丹，而是能救治多少生灵。这一路走来，他失去过，痛苦过，但从未放弃过。
而此刻，重生的林素衣正站在他身边，药香环绕着她的身影，仿佛为她披上了一层霞衣。他们相视一笑，在晨光中共炼灵药，新的故事正在药香中缓缓展开。