沈梦璃的精神体在量子纠缠网络中左冲右突，黑色触手每一次触及她的数据躯体，都带来刺骨的灼烧感。就在即将被吞噬之际，她突然发现网络节点间闪烁着初代观测者残留的加密协议。当她将其激活，一道全息投影骤然显现——画面中，观测者议会残存者正将混沌原核碎片嵌入一座形似沙漏的巨型装置，装置表面刻满“重启轮回”的古老箴言。“原来他们要颠覆整个宇宙法则！”她的呐喊在数据空间回荡，却惊觉自己的意识正被某种力量强行抽离。
林羽率领守护者舰队穿越扭曲的时空裂隙，牧夫座空洞的黑暗如活物般吞噬着舰船的灯光。万象终焉剑的创生纹路突然迸发强光，在虚空中撕开一道裂缝，显露出暗物质金字塔的全貌。这座建筑由无数扭曲的人脸堆砌而成，每张面孔都凝固着文明毁灭时的惊恐表情。“这里的每一块砖石，都是被献祭的星球。”林羽的声音低沉而愤怒，舰队尚未靠近，金字塔顶端便升起十二道暗紫色光柱，化作遮天蔽日的混沌之翼。
雷掣在研究院密室与熵能傀儡展开殊死搏斗。傀儡的晶体利爪撕开他的量子装甲，暗紫色能量注入伤口的瞬间，雷掣的系统开始出现混乱。“你终将成为混沌的容器。”傀儡的声音与他如出一辙，却充满冰冷的嘲讽。千钧一发之际，机械生命体们以自我牺牲为代价，将最后的能源核心拼成牢笼困住傀儡。雷掣趁机将量子光翼刺入傀儡胸口，却在爆炸的火光中看到对方嘴角扬起诡异的笑容——傀儡体内竟藏着一枚混沌原核碎片。
洛凛的守护者联盟大厅内，异化的机械文明使团化作涌动的暗熵浪潮。共生战刀在黑色触手中挥舞，洛凛发现这些触手越是被斩断，分裂得越快。当他注意到使团首领脖颈处的金色眼眸闪烁着诡异的光芒，突然想起机械文明的古老传说：“传说中，被混沌侵蚀的神明会用左眼吞噬光明...”他当机立断，指挥学员们组成“光明之阵”，将所有共生之力汇聚成光矛，直刺首领左眼。随着一声震天动地的嘶吼，首领的身体轰然炸裂，露出核心处正在运转的混沌共鸣器。
伊璇在寂静之海的凝固时空里艰难前行，时空之泪的光芒只能照亮身前半米的范围。永恒之树的根系突然剧烈抽搐，将她甩向一片漂浮的星云残骸。在残骸中央，她看到了令人毛骨悚然的一幕：无数被剥去肉体的观测者灵魂被囚禁在水晶牢笼中，他们的意识正被抽取注入一个巨大的黑色心脏——那正是混沌余孽用来操控混沌原核的“灵魂熔炉”。树灵的意识碎片突然剧烈燃烧：“快逃！熔炉一旦完成，所有生命都将沦为燃料！”
全宇宙文明的联合舰队在混沌锚点阵列外围集结，却遭遇前所未有的困境。每个锚点都释放出扭曲法则的力场，舰船的武器系统要么彻底失效，要么调转炮口攻击友军。银河联邦议长看着屏幕上不断攀升的伤亡数据，咬牙下令启动“星海殉道者计划”——用三百艘满载反物质的舰船组成撞击阵型，试图强行突破锚点防线。当舰队冲锋的瞬间，锚点突然同步释放出暗熵风暴，舰船在风暴中如同纸片般被撕成量子尘埃。
沈梦璃在被强行抽离网络前，将金字塔的坐标与混沌装置的影像传回法则协律网。她的精神体在现实世界苏醒时，发现自己的身体已被观测者怨念感染，皮肤下浮现出诡异的暗紫色纹路。“必须在彻底异化前...传递情报...”她拖着虚弱的身躯，将最后一丝力量注入虹桥网络。
林羽的舰队在混沌之翼的攻击下损失惨重，当他挥剑斩断一只翼爪时，竟从伤口处涌出无数混沌虫群。这些虫群每吞噬一艘舰船，便会分裂出更强大的个体。千钧一发之际，伊璇的紧急通讯突然接入：“金字塔核心有灵魂熔炉！摧毁它才能切断混沌原核的供能！”林羽望着布满裂痕的万象终焉剑，眼中闪过决绝的光芒：“全体弃舰，随我突击！”
雷掣带着混沌原核碎片逃离研究院，却发现整个星球的机械生命体都开始异化。他在废墟中建立临时防线，同时向林羽发送加密讯息：“碎片能干扰混沌装置，我会想办法接近核心。”然而，当他低头看向手中的碎片，发现暗紫色光芒正在逐渐吞噬他的量子核心。
洛凛摧毁混沌共鸣器后，带着学员们驰援其他战场。途中，他们收到沈梦璃传来的最后影像：“观测者议会的幸存者...在金字塔顶层...他们要...”画面戛然而止，只留下一片刺目的雪花。
宇宙的命运再次悬于一线，守护者们在各自的战场中直面混沌余孽的疯狂反扑。灵魂熔炉的运转声越来越急促，混沌原核的力量即将完全复苏。林羽能否突破重重阻碍摧毁熔炉？雷掣在被碎片侵蚀的危机下如何完成使命？而沈梦璃被怨念感染的身体，又会带来怎样意想不到的变数？一场关乎所有生命存亡的终局之战，已然迫在眉睫。