在星穹守望者与神秘生物的激战中，洛凛发现这些生物的行动似乎受到某种信号的精确控制，它们的攻击模式开始变得有序且极具针对性。雷掣通过对神秘生物能量信号的追踪，确定了信号源来自宇宙的一个未知区域，那是一片被黑暗笼罩的星云，散发着令人不安的波动。这片星云的边缘漂浮着数以万计的晶体残骸，每一块都残留着诡异的精神波动，仿佛在无声诉说着曾经的文明悲剧。
与此同时，沈梦璃在虹桥网络中察觉到一些文明的思想开始被侵蚀，机械帝国和魔法星系的矛盾逐渐激化，其他文明也开始出现不稳定的情绪。她全力稳定网络，防止思想侵蚀进一步扩散，并将这一情况告知林羽。林羽意识到，宇宙议会的联盟正面临着前所未有的考验，内部的矛盾和外部的威胁相互交织，稍有不慎，宇宙将陷入更深的危机。他召集议会紧急会议时，发现会场中不少代表的瞳孔深处闪烁着幽蓝的微光——那是被精神控制的迹象。
为了探寻真相，林羽决定带领守护者们前往那片神秘星云。他们驾驶着星穹号Ω-14，穿越宇宙的黑暗地带。在接近星云时，星舰的系统突然失灵，周围的空间开始扭曲，仿佛有一股强大的力量试图阻止他们前进。洛凛操控着星舰，与扭曲的空间进行艰难对抗，雷掣则全力修复系统，沈梦璃运用精神力试图突破这股强大的力量。此时，星舰的量子雷达突然捕捉到一段古老的广播：“不要靠近……那是……吞噬一切的……”话音戛然而止，却让众人脊背发凉。
伊璇在世界树的核心，感受到世界树的根系开始萎缩，生命能量不断流失。她与世界树的意识进行沟通，发现这一切都与神秘星云的力量有关。伊璇将生命能量注入世界树，稳定其根系，同时向守护者们传递信息：“神秘星云的力量正在汲取宇宙的生命能量，我们必须阻止它！”世界树的年轮中浮现出古老的预言图像，显示着一个巨大的机械装置正在将宇宙压缩成黑暗的奇点。
当星穹号Ω-14终于突破重重阻碍，进入神秘星云内部时，守护者们发现这里隐藏着一个巨大的机械装置。这个装置由无数齿轮嵌套而成，每一个齿轮都刻满了早已失传的星际文字，装置顶部悬浮着一颗不断脉动的黑色晶体，正是能量核心所在。装置周围环绕着神秘生物，它们如同忠诚的守卫，阻止守护者们靠近。林羽挥舞星痕剑，剑刃上的光暗之力与神秘生物的能量相互碰撞，发出耀眼的光芒。沈梦璃在虹桥网络中发现，这个机械装置正在向宇宙议会的各个文明发送干扰信号，加剧文明之间的矛盾，更可怕的是，这些信号中还夹杂着能够瓦解灵魂的「虚无频率」。
雷掣运用寰宇织机，解析机械装置的结构和能量运行模式。他发现，装置的核心是一个巨大的能量核心，散发着与幽蓝之眼和暗影之主相似的黑暗能量，其内部的能量循环系统竟与宇宙大爆炸的模型如出一辙——这根本是一台能够重启宇宙的「归零引擎」。洛凛带领星穹守望者们与神秘生物展开殊死搏斗，他们的共生之刃在黑暗中闪烁着光芒，试图突破生物的防线。但每击败一只生物，其残骸就会化作黑色雾气融入装置，增强装置的力量。
在激烈的战斗中，林羽突然感受到一股强大的意识从能量核心中传出：“愚蠢的守护者，宇宙的秩序本就应该被重塑，你们不过是旧秩序的维护者！”林羽回应道：“真正的秩序是让所有文明和谐共生，你们的重塑不过是毁灭的借口！”然而对方却发出刺耳的笑声：“看看你们身后——那些被控制的文明，正举着武器指向彼此！”通过星舰的观测窗，守护者们惊恐地看到，数十个文明的舰队正在宇宙议会总部外集结，炮火蓄势待发。
此时，装置的能量核心突然爆发出刺目黑光，整个星云开始坍缩，形成一个能够吞噬星系的黑洞。雷掣大喊：“必须在黑洞成型前摧毁能量核心！但装置表面的防护罩正在吸收我们的攻击！”沈梦璃的精神体在高强度对抗中开始崩解，她咬牙将虹桥网络的所有能量注入星痕剑；洛凛的共生之刃与守望者们的武器共鸣，形成一道银色光网牵制神秘生物；伊璇耗尽最后的生命能量，让世界树的根系突破空间限制，缠绕住装置的齿轮。林羽将光暗之力提升到极致，星痕剑化作一道贯穿时空的光芒，刺向能量核心……而在黑洞的边缘，一个戴着兜帽的身影正冷冷注视着这场生死之战，他的手中握着一枚刻满未知符文的戒指，轻轻转动间，宇宙的命运之轮开始加速转动。