却说王敦晕倒床上，不省人事，惊动帐下一班党羽，都来到床前看视，设法营救，才见王敦苏醒转来。
王敦长叹数声，张目四顾，看见舅羊鉴及养子王应，俱在床侧，便呜咽道：“我已不望再活了。我死后，王应便即位，先立朝廷百官，然后办理丧事，方不负我一番经营。”还想做死皇帝么？
羊鉴与王应唯唯受命。过了一天晚上，王敦就病死了，王应秘不发丧，用席子包裹王敦尸身，外面涂蜡，埋在议事厅中，和诸葛瑶等人日夜纵酒淫乐，不顾军情。
王含自江宁败后，退驻数里，遥遥而催促沈充会师，再图进攻。
晋明帝也恐沈充前来，特遣廷臣沈桢，前往说服沈充，许为司空，劝令投诚。
沈充摇首道：“三司重任，我何敢当。古人谓币重言甘，实是诱我，今日正应此语。况丈夫共事，始终不移，若中道变心，便失信义，将来还有何人容我呢？”沈充明知顺逆，却依然为王敦死心塌地，自寻死路。遂举兵趋江宁。
宗正卿虞潭，因病乞休，辞还会稽故里，至是独起义余姚，传发檄文，讨伐沈充。
晋明帝司马绍即授虞潭为会稽内史。前安东将军刘超，宣城内史钟雅，亦皆招募士兵举义，与沈充为敌。
义兴人周蹇，杀死王敦所署太守刘芳，平西将军祖约，亦逐王敦所署淮南太守任台，彼此俱效命朝廷，交口讨逆。
沈充尚怙恶不悛，自率万余人，兼程北行，与王含合兵。
司马顾扬对沈充说道：“今欲举大事，偏被王师先扼咽喉，锋摧气沮，相持日久，必致祸败。今不若决破栅塘，引湖中水，灌入京邑，一面乘着水势，纵舟进攻，这便是不战屈人的上计。此计不行，或借我军初至的锐气，并合东西各军，十道并进，我众彼寡，所向必摧，尚不失为中计。若欲转祸为福。因败为成，诱召钱凤计事，设伏斩凤，携首出降，乃是今日的下计。”
我谓下计，却是上计。沈充迟疑半晌，终不作答。顾扬料想沈充所做之事定然无成，于是遁归吴兴。
那兖州刺史刘遐，临淮太守苏峻，已各率精兵万人，同来勤王。晋明帝连夜召见，慰劳有加，并出库帛分赐将士，众皆踊跃。
沈充、钱凤，欲因北军初到，迎头进击，乃自竹格渚渡淮，直前攻扑。护军将军应詹，建威将军赵胤等，拒战失利，退至宣阳门。
沈充与钱凤乘胜进逼，拔栅将战，不意刘遐、苏峻，从东塘横击过来，把沈充、钱凤两军冲断，再加应詹、赵胤，也来助战，杀得沈充和钱凤大败亏输，夺路飞奔，还逾淮水，人不及济，后面追兵大至。叛众纷纷投水，溺毙至三千人。刘遐尾追不舍，行至青溪，又奋击沈充一阵，沈充狼狈走脱。
寻阳太守周光，乃是周抚之弟，因王敦举兵，也率数千人助王敦。既而来到姑孰，与王应相见，便欲入省王敦之疾。
王应嗫嚅道：“我父病中，不愿见客，且待异日进见吧！”
周光退出，与士兵语道：“我远道来赴，不得一见王公，想必是已死了。”
话罢，周光遂急赴军前，去探乃兄。周抚闻周光至，当然出来相见，周光开口便告诉周抚说道：“王公已死，兄何故与钱凤作贼？”大众闻言，都不胜惊愕，连周抚亦有悔心，即夕遁还。王含势孤失援，也毁营夜遁。
晋明帝本已出屯南皇堂，闻叛党尽走，于是还宫大赦，惟王敦党羽不在赦免之例。申达命令庾亮督同苏峻等军，前往追拿沈充。
温峤督同刘遐等，往追王含、钱凤。王含奔回姑孰，拟挈王应同奔荆州。
王应谓不如投依江州。王含皱眉道：“大将军生前，与江州屡有龃龉，奈何往矣？”
王应答道：“正为江州平日异趋，所以宜往。彼时大将军兵马强盛，江州尚不肯阿附，识见高出常人，今见我困厄，必然相怜，不致加害。若荆州守文拘谨，怎能意外行事呢？”王应虽少智过乃父，但天道恶淫，岂容竖子漏网？
王含不肯依言，竟与王应载一扁舟，往奔荆州。荆州刺史王舒，遣兵出门来迎。俟得王含父子入城，立刻下达命令将其拿下，缚住手足，投诸江中，眼见是葬身鱼腹了。
江州刺史王彬，却密具舟楫，静待王含父子，日久不至，料知窜死，却引为己恨。王含为逆，何足深惜，王彬亦未知大体。
钱凤走至阖庐洲，为周光所杀，函首诣阙，自赎前愆。沈充奔回吴兴，闻故吴内史张茂之妻陆氏，招收张茂旧部，在途中守候沈充至，将执沈充脔割，为夫复仇。
张茂乃为沈充所杀，沈充不敢竟归，绕道奔窜，竟致失路，误入故将周儒之家。周儒贪东晋朝廷的奖赏，诱导沈充进入复壁之中，因而笑语沈充道：“我今日得三千户侯了。”
沈充始知为周儒所赚，乃流涕与语道：“汝能顾义活我，我必厚报，若为利杀我，我死必令汝灭族，不要后悔。”
周儒竟而杀死沈充，传送其首级到建康。沈充之子沈劲，按例当坐诛，为乡人钱举所藏匿，幸得免死。后来沈劲竟灭周氏，如沈充所言。沈充为叛贼，顾能作厉鬼耶？
晋朝廷因叛党悉平，当然解除戒严。有司发掘王敦尸首，焚去衣冠，扶尸跪着，枭去首级，与沈充首级同悬高桥。
郗鉴入奏晋明帝道：“前朝诛杨骏等人，皆先加官刑，后听私殡。臣以为逆敦既伏王诛，不妨使全私义，可听敦家收葬，借示皇恩。”
晋明帝准如所请，乃将王敦首级取下，听令葬埋。王敦党人周抚、邓岳，相 偕出兵而战亡。
周抚之弟周光拟给兄长路资，暗中图谋捉拿邓岳。周抚怒道：“我与邓伯山同亡，如欲害邓，宁先杀我。”伯山即是邓岳的表字。
过一会邓岳来到，周抚即走出来，遥与邓岳语道：“快去！快去！我弟尚不相容，何论他人。”
邓岳回身返走。周抚亦取得旅途盘缠，追及邓岳，一同逃窜进入西阳蛮中。后来再经大赦，才得东还。
晋明帝司马绍加封王导为始兴公，温峤为建宁公，卞壷为建兴公，庾亮为永昌公，刘遐为泉陵公，苏峻为邵陵公，郗鉴为高平侯，应詹为观阳侯，卞敦为益阳侯，赵胤为湘南侯，下此按功晋秩，不胜殚述。
有司奏称王彬等为王敦亲族，均应除名，复诏谓：“司徒导大义灭亲，应宥及百世，况彬等皆司徒近支，毋庸再问。”大义灭亲四字，恐王导不足当此。惟王敦纲纪，悉令除籍，参佐并皆禁锢。温峤又上疏解免道：
王敦刚愎不仁，忍行杀戮，亲任小人，疏远君子，朝廷所不能制，骨肉所不能阻，处其朝者，恒惧危亡，故士人结舌，道路以目，诚贤人君子，道穷数尽，遵养时晦之辰也。且敦为大逆之日，拘录人士，自免无路，原其私心，岂遑宴处？如陆玩、羊曼、刘胤、蔡谟、郭璞，常与臣言，备知之矣。必其赞导凶悖，自当正以典刑，如其枉陷奸党，还宜施之以宽。臣以玩等之诚，闻于圣听，当受同贼之责，苟默而不言，实负其心。陛下仁圣含弘，思求允中，臣阶缘博纳，于非其事，诚在爱才，不忘忠益，谨昧死上闻！
晋明帝司马绍览疏文，颇加感动，特下群臣议决。郗鉴谓：“君臣有义，义在死节，不应偷生。王敦佐吏，虽多被胁，但进不能谏止逆谋，退不能脱身远引，有亏臣道，宜加义责。”
此外或从温峤建议，或如郗鉴之言，论久未决。还是晋明帝有意行仁，终从温峤所请，于是王敦党羽皆免连坐。
张茂妻子陆氏，诣阙上书，语多哀痛，表面上是为张茂谢罪，说他不能克敌，自致阵亡，实际上是为张茂请封，无非说是“略迹原心，应待恩恤”等语。
晋明帝司马绍于是赠张茂太仆，且拨库帑，怃恤遗孥。陆氏始谢恩归家。也算一个奇妇人。即而再叙前勋，命王导为太保，兼领司徒，西阳王羕领太尉，应詹为江州刺史，刘遐为徐州刺史，苏峻为历阳内史，庾亮加护军将军，温峤加前将军，惟王导固辞不受。江州本由王彬镇守，骤遭易任，吏民未安。嗣经詹加意怀柔，才得翕服。
转瞬又是一年，晋明帝司马绍追赠谯王承、甘卓、戴渊、周顗、虞望、郭璞、王澄等官，不及周札。
周札故吏为周札讼冤，尚书卞壷，谓札居守石头，开门延寇，不当追赠。偏王导出来申辩道：“往年周札驻守石头城，王敦逆迹未彰，如臣等俱昧先几，无怪一札。要想回护自己，不得不回护周札。后来瞧破逆情，周札便举身委国，横被诛夷。周札未尝有义举，怎得谓举身许国？臣意宜与周戴同例，一并赠谥。”
郗鉴听着，心下很是不服。便从旁参议道：“周戴死节，周札延寇，迹异赏同，何从劝善？如司徒议，谓往年王敦犯顺，不妨延纳，是谯王周戴等，俱当加责，何得赠谥？今三臣既予褒扬，札尚不应加贬么？”是极。
王导尚强辩道：“札与谯王周戴，虽所见不同，后来均至死节，奈何必吹毛索瘢呢？”
郗鉴又道：“王敦谋逆，好似履霜坚冰，由来已久，必谓敦往年入犯，义等桓文，难道先帝亦如幽厉么？”说到此语，驳得王导俯首无词。晋明帝终不忍违王导所请，仍赠周札与官。
会因储君未立，国本有关，晋明帝乃立长子司马衍为皇太子。司马衍为皇后庾氏所出，年甫五龄，受册礼毕，大酺三日，增文武官员各二级，赐鳏寡孤独布帛，每人二匹。调荆州刺史王舒为安南将军，都督广州诸军事，领广州刺史，即迁陶侃为征西大将军，都督荆湘雍梁诸军事，领荆州刺史。
陶侃生性聪慧敏捷，做人谨慎，为官勤恳，整天严肃端坐。军中府中众多的事情，自上而下去检查管理，没有遗漏，不曾有片刻清闲。招待或送行有序，门前没有停留或等待之人。他常对人说：“大禹是圣人，还十分珍惜时间；至于普通人则更应该珍惜分分秒秒的时间，怎么能够游乐纵酒？活着的时候对人没有益处，死了也不被后人记起，这是自己毁灭自己啊！”
陶侃的部下中有人闲于游戏而荒废职事，陶侃命令将其酒器、赌具都投入江中，并鞭打吏将，对他们说：“樗蒱赌博是牧猪奴的游戏，《老子》《庄子》浮华不实，不是先王的明法正言，实不可行。君子当正其衣冠，振其威仪，那有蓬乱着头发来培养声望还自称豁达的人。”
有人送礼物给他的，都要询问来由，若是自己出力得来的，即使礼物轻微也很高兴，陶侃回赠的东西更多。若这礼物来路不正，则严厉斥责，绝不收取。
有一次，陶侃外出，看见一个人手拿一把未熟稻谷，陶侃问：“你拿它做什么？”那人回答：“在路上看见的，就随意拿来罢了。”陶侃大怒说：“你既不种田，又拿别人的稻子戏耍！”陶侃抓住他鞭打他，因此百姓勤于农事，家中充足。
在造船的时候，陶侃命人把木屑和竹头都登记后收藏起来，人们都不明白这样做的原因。后来大年初一聚会时，地面积雪，太阳刚放晴，厅堂前积雪，地面还潮湿，陶侃于是用木屑铺散地面。等到桓温伐蜀时，又用陶侃保存的竹头作钉装船。陶侃综合料理事物极其细密，都是这样。这且慢表。
且说晋明帝司马绍既调令王舒到广州，寻复徙镇湘州，即以湘州刺史刘顗，移督广州，复命尚书令郗鉴，为车骑将军，都督青兖二州军事，暂镇广陵。授领军将军卞壷为尚书令，寻复进尚书仆射，荀崧为光禄大夫，录尚书事，用尚书邓攸为尚书左仆射。
到了闰七月间，晋明帝司马绍忽得暴病，医药罔效，势且垂危，亟召太宰西阳王羕，司徒王导，尚书令卞壷，车骑将军郗鉴，护军将军庾亮，前将军温峤，领军将军陆晔，并受遗诏，使其辅助太子，遗诏书云：
自古有死，贤圣所同。寿夭穷达，归于一概，亦何足深痛哉？朕抱病日剧，常虑忽然，仰惟祖宗洪基，不能克终堂构，大耻未雪，百姓涂炭，所以有慨耳。不幸之日，敛以时服，一遵先度，务从俭约，劳众崇饰，皆勿为也。衍以幼弱，猥当大重，当赖忠贤，训而成之。昔周公匡辅成王，霍氏拥育孝昭，义存前典，功冠二代，岂非宗臣之道乎？凡此公卿，时之望也，敬听顾命，任托付之重，同心断金，以谋王室。诸方岳征镇刺史将守，皆朕扞城推毂于外，虽事有内外，其致一也。故不有行者，谁扞牧圉？臂若唇齿，表里相资，宜戮力一心，若合符契，要以缉事为期。百辟卿士，其总己以听于冢宰，保佑冲幼，弘济艰难，永令祖宗之灵，宁于九天之上，则朕没于地下，无恨黄泉。特此留谕，钦哉惟命！
越日，晋明帝驾崩，年仅二十七岁，在位只得三年。
右卫将军虞胤，左卫将军南顿王宗，本得晋明帝亲信，使典禁兵，入值殿内，掌守宫门管钥。当晋明帝寝疾时，庾亮曾夜入奏事，向王宗求钥。王宗辄不给与，且叱责庾亮使道：“这难道是汝家门户，好自由出入么？”语亦近理，但不察缓急事宜，一味蛮言，亦属非是。
庾亮从此怨恨王宗。及晋明帝疾笃，群臣多不得进见。庾亮怀疑王宗和虞胤有异谋，排闼入见，请黜逐二人，晋明帝不从。既授遗诏，更命庾亮为中书令，庾亮因得专政。
太子司马衍承统嗣位，群臣奉上玺绶，独王导称疾不至。无非是忌惮这个庾亮。
卞壷入朝正色道：“王公非社稷臣，大行在殡，嗣皇甫立，岂是大臣辞疾时么？”这数语传入王导之耳，王导乃舆疾而至，谒见新主，行即位礼。再由大众会议，谓嗣皇帝年仅五龄，不能亲政，应请其母后临朝。
于是尊母后庾氏为皇太后，垂帘训政。命王导录尚书事，与中书令庾亮，夹辅帝室。
王导遇事退让，推举庾亮主持。庾亮又是太后之亲兄长，太后当然倚任，所以军国重事，全归庾亮一人裁决，王导不过列一虚名罢了。
庾亮迁南顿王宗为骠骑将军，改授汝南王佑为卫将军，一面料理丧葬，至十月初旬，奉司马绍的梓宫出葬武平陵，庙号肃祖，尊谥曰明。晋明帝在位三年，能奋发有为，亲 除大憝，不可谓非英主。谥法称明，却是名实相符。可惜天不永年，未壮即殁。至太子司马衍立，便是晋成帝，越年改元咸和。
尚书左仆射邓攸，及徐州刺史刘遐、江州刺史应詹，相继去世。
邓攸就是邓伯道，七岁丧父，而后又连丧母亲、祖母。他先后服丧九年，以孝道着称。
邓攸成年后，被举为灼然二品（九品中正中的第二品），又被吴王司马晏辟为吴王文学，历任太子洗马、东海王参军。东海王司马越钦佩邓攸的人品，让他进入世子司马毗的幕府，授为东海世子文学、吏部郎。后来，新蔡王司马腾出任东中郎将，又征辟邓攸为长。
西晋末年，邓攸出任河东太守，后在永嘉之乱中被汉国大将石勒（羯族人）的军队俘虏。石勒一向仇视汉官，听闻部下俘获邓攸，派人召他来见，欲将其斩杀。邓攸来到石勒营门，却发现门吏乃是早年旧识，于是索要纸笔，作辞诀别。门吏在石勒高兴的时候，将辞文呈上。石勒很赏识邓攸的文辞，便没有杀他。石勒的长史张宾曾与邓攸比邻而居，也在石勒面前称赞他。石勒便召见邓攸，授其为参军，每逢征战都将他安置在车营中。
石勒军中夜间禁火，违犯者都要被处死。邓攸的车子与一胡人相邻，结果胡人夜里失火，烧毁车辆，还在接受调查时诬陷邓攸。邓攸自知无法与他争辩，便假称是为弟妇温酒，以致引起失火。但石勒却赦免了邓攸，未加治罪。后来，引起失火的胡人感念邓攸的恩德，自缚去见石勒，为邓攸辩白，还暗中赠以马驴。诸胡人得知，无不叹息，对邓攸敬服不已。
邓攸虽接受石勒任命的官职，但仍想返回晋朝，因此在石勒兵渡泗水时趁机逃离。
邓攸从石勒军中逃离后，带着妻儿逃难。他自知不能同时保住儿子与侄子，便对妻子贾氏道：“我弟弟早死，只有一个儿子，按理不能使他绝嗣，只能舍弃我们自己的儿子。如果我们能够幸存，将来一定能再生儿子的。”贾氏含泪应允。但儿子被丢弃后，却总是追上父母。邓攸只得将他绑在树上，带着妻子与侄子离去。
他砍坏车子，用牛马驮着妻子逃走，但中途又被强盗掠走牛马，只得步行逃难。邓攸逃到新郑（今河南新郑）后，依附当地坞主李矩。
邓攸在李矩门下三年，后打算离去，却被李矩拒绝。此后，不论是司空荀组任命邓攸为陈郡、汝南太守，还是晋愍帝征拜其为尚书左丞、长水校尉，李矩始终不肯让邓攸离开。但是邓攸最终还是偷偷离去，前往许昌（今河南许昌）投奔荀组。李矩为此恼恨不已，过了很久才将邓攸的家属送还于他。
东晋建立后，邓攸因与刁协、周顗交好，遂渡江南下，被晋元帝任命为太子中庶子，后又拜为吴郡太守。他赴任之时，自载米粮，平时只喝吴郡的水，并不接受俸禄。
太兴二年（319年），吴郡发生饥荒，饿死百姓无数。邓攸上表朝廷，请求开仓赈济，而后未等朝廷答复，便擅自开仓救济饥民。后来，尚书台派遣散骑常侍桓彝、黄门侍郎虞囗前往吴郡，慰劳饥民，访查邓攸的治绩。桓彝二人弹劾邓攸擅自开仓之罪，但朝廷却未予追究。
邓攸因病辞去吴郡太守后，被征拜为侍中，一年后改任吏部尚书。他平时弊衣蔬食，生活简朴，却经常扶危济贫。在与他人交往时，不论贵贱都能一视同仁，只是有些敬媚权贵。永昌二年（323年），邓攸又接替周顗，出任护军将军。
太宁二年（324年），王敦反晋。晋明帝密谋起兵平叛，改任邓攸为会稽太守。邓攸接到调令，便离职在家，不再管理护军府事务。但有朝臣与邓攸不睦，竟在明帝面前诬告邓攸，称他仍按旧例每月都向王敦汇报全国兵数。晋明帝虽没有相信，却将邓攸改任为太常。
王敦之乱平定后，晋明帝在南郊举行祭天大礼。邓攸病重未能参加，但听闻明帝亲来探病，只得抱病勉力出迎。有司为此弹劾邓攸，称他不能去参加南郊祭天，却能在道边迎拜皇帝。邓攸因此被免职。但他生性淡泊，不论官职升黜，都毫无喜愠之色。
当初邓攸逃离石勒渡江后，因妻子贾氏始终未能再孕，便纳一姬妾，后来在询问其亲属姓名的时候，方才知道刚刚纳的妾乃是自己的外甥女。他素来有德行重伦理，为此悔恨不已，从此不再纳妾。因而到死也没能再生出儿子。
太宁三年（325年）闰八月，邓攸升任尚书左仆射。咸和元年（326年）四月，邓攸在左仆射任上病逝。晋成帝追赠他为光禄大夫，加授金章紫绶，并以少牢之礼祭祀。
时人曾感叹为天道无知，乃使伯道无儿。从子邓绥服丧三年，悲号擗踊，不啻亲生，这也好算得恩义两全了。犹子比儿，可为伯道一慰。
刘遐，字正长，广平易阳人。刘遐性果敢坚毅，弓马娴熟，开朗勇猛。正逢天下大乱，刘遐为坞主，每次作战他都率壮士冲锋陷阵，冀地人把他比作张飞、关羽。同乡人冀州刺史邵续器重刘遐，把女儿嫁给他，于是在河、济之间筑垒，敌人不敢逼近。晋元帝任命他为龙骧将军、平原内史。建武初年，兼任下邳内史。
当初，沛郡人周坚（又名周抚），与同郡周默趁着天下混乱，都作了堡主，专门进行劫掠。太兴二年（319年），周默投降祖逖，周抚发怒，就袭击杀死周默，在彭城举兵反叛，后赵皇帝石勒派骑兵援助他。晋元帝诏令刘遐兼任彭城内史，与徐州刺史蔡豹、泰山太守徐龛一同讨伐周抚，在寒山交战，周抚战败逃走。晋元帝诏令调任刘遐为临淮太守。同年四月，徐龛反叛。徐龛叛乱平定后，晋元帝任命刘遐为北中郎将、兖州刺史。
太宁二年（324年）正月，后赵将领侵犯兖州，刘遐从彭城退守到泗口。
同年六月，王含反叛，刘遐与苏峻等奔赴京都护卫。
王含兵败后，刘遐跟随丹杨尹温峤追击王含到淮南，刘遐纵兵掳掠。温峤说：“天道助顺，所以王含被剿灭，不能趁乱作乱。”刘遐深深地责备自己而谢罪。事情平定后，刘遐因功封泉陵公，升任散骑常侍、监淮北军事、北中郎将、徐州刺史、假节，代替王邃镇守淮阴。
咸和元年（326年）初五日，刘遐去世，朝廷追赠他为安北将军。
应詹，字思远，汝南郡南顿县（今河南项城）人。
应詹幼年时便成为了孤儿，得到祖母的抚养。应詹十几岁的时候，祖母又过世了，他在守丧期间，身体憔悴哀毁，需要拄杖才能起身，便以孝顺而闻名。
应詹家中很富有，他年纪又小，就请族人与自己一起居住，把财产交给他们，就像对至亲的人一样，世人都惊讶于他的与众不同。
他年轻时就已很出名，他的性格宽宏雅正，他人虽然时有冒犯他而他却不与人计较，以研习文章而为人所称颂。司徒何劭见过他后说：“这个人是个君子啊！”
最初被公府征辟，担任太子舍人。被赵王司马伦任命为征东将军长史，司马伦被诛杀后，应詹也被牵连罢免。又被成都王司马颖起用为掾属。当时骠骑将军从事中郎诸葛玫背弃长沙王司马乂到邺投奔司马颖，大谈司马乂的过错。诸葛玫浮躁而有才辩，临漳的士人都去归附他。应詹与诸葛玫是旧交，他感叹道：“诸葛成林，怎么像乐毅那样不忠诚呢！”终究没有见他。诸葛玫听到这话后非常惭愧。
镇南大将军刘弘是应詹的祖舅，请他担任自己的长史，并对他说：“你器识宏大深远，以后应该在荆南一带接替老夫了。”接着，托付他军政大事。刘弘在汉南的功业，有应詹的功劳。后来调任南平太守。
永兴二年（305年），陈敏叛乱，引兵想要西上，刘弘将南蛮校尉之职授予前北军中候蒋超。亲自统领陶侃、苗光等人屯于夏口。又派治中何松统领建平、宜都、襄阳三郡之兵，屯驻巴东，为益州刺史罗尚的后继。再加应詹为宁远将军，督三郡水军，作为蒋超的后援。
王澄任荆州刺史时，暂命应詹督管南平、天门和武陵三郡军事。当洛阳被刘曜攻破时，应詹撩起袖子痛哭流涕，劝王澄派军支援，王澄就让应詹写发兵檄文，应詹下笔便成，檄文豪壮激越，众人看了都情绪激动，但终究没有前往救援。此时，天门、武陵的少数民族纷纷造反，应詹率军讨伐将其降服。
当时政令不一，少数民族都心怀不满，共同谋划发动叛乱，应詹召集了他们的首领，破铜卷与他们订立盟约，当地夷人都对应詹心悦诚服，好几个郡都因此获得安宁。当时天下大乱，只有应詹治下仍能保持安定。百姓作歌称颂他说：“乱离既普，殆为灰朽。侥幸之运，赖兹应后。岁寒不凋，孤境独守。拯我涂炭，惠隆丘阜。润同江海，恩犹父母。
之后，征南将军山简暂命应詹督管五郡军事，当时爆发了杜弢起义，杜弢军进攻应詹治下之郡，应詹率军力战将其击破。不久后联合陶侃在长沙大破杜弢，截获金银财宝无数，应詹一无所取，只把图书整理起来，众人无不赞叹。琅玡王司马睿任命应詹为建武将军， 王敦又推荐应詹监巴东五郡军事，赐爵颍阳乡侯。
陈郡人王冲占据了荆州，素来仰慕应詹的名声，想请他来担任刺史，应詹认为王冲没什么才德，不肯接受，于是返回南平，王冲也不生气，他就是这样的得人心。应詹后来迁任益州刺史，兼领巴东监军，他离开南平时，士庶百姓都拉着车子哭着不让他走，如同眷恋自己的亲人一样。
不久，被任命为后军将军，应詹对时政提出建议，认为“今大荒之后，制度改创，宜因斯会，厘正宪则，先举盛德元功以为封首，则圣世之化比隆唐虞矣。”又上疏说：“自汉宣帝元康年间以来，轻视典籍，崇尚道学，把玄虚弘放视作平达，把儒术、清俭看作鄙俗，如今应当尊崇和奖掖儒官，来革新风俗教化。”
晋元帝司马睿很是看重他的才能，完全采纳了他的意见。不久，又出任吴国内史，因公事被免职。
镇北将军刘隗出镇合肥时，任命应詹为镇北将军军司，又加职散骑常侍，经屡次升迁任光禄勋。应詹因为王敦专制、四处树立威信，所以他在任上只是“优游讽咏”，并不表明自己的倾向。
等到王敦命王含等率军逼近建康时，晋明帝司马绍向应詹问计。应詹表情严肃情绪激昂的说：“陛下应发出君王的威严，臣等当全副武装作为前驱，希望凭借宗庙之灵，不战而胜。如其不然，王室必危。”
晋明帝司马绍于是任命应詹为都督前锋军事、护军将军、假节，又都督朱雀桥南。叛军从竹格渡江，应詹与建威将军赵胤等率军将其击败，斩杀叛军将领杜发，斩首数千级。太宁二年（324年），王敦之乱平定后，应詹受封观阳县侯，食邑一千六百户，又赐绢五千匹。应詹上疏辞让，晋明帝不许。
太宁二年（324年）十月，又改任使持节、都督江州诸军事、平南将军、江州刺史。应詹将要出镇时，上疏认为应该任用人才，并分派官员巡查郡国、检举不法。又建议严格执行旧时的降职制度，还针对地方提出了一些意见。
当时王敦之乱刚刚平息，人心未安，应詹抚慰怀柔，众人无不悦服，百姓都依赖他。
咸和元年（326年）七月二十五日（9月8日），应詹逝世，享年五十三岁。被晋朝廷追赠为镇南大将军、仪同三司，谥号“烈”，以太牢礼祭祀。临终时，他仍然不忘国家，给陶侃去信，望陶侃能“竭节本朝，报恩幼主”。
当初永嘉之乱时，京兆人韦泓的亲人都因饥荒而死，韦泓从异乡来到洛阳，他很久以来都听闻应詹的名声，于是前来归附应詹。应詹与他同甘共苦、情同兄弟。韦泓随从应詹数年，应詹为他寻找妻子、建置居所，并向晋元帝推荐他，晋元帝立即起用韦泓。
韦泓此后，官至少府卿。韦泓受应詹接济生活及推荐为官的恩惠，应詹去世后，韦泓马上制作了朋友所着的丧服，直到墓上有了新草才停止哭泣，追慕古时候赵氏祭祀程婴、杵臼的节义，终身祭祀应詹。
江州百姓，听闻应詹病殁，远近举哀。
百姓哀伤而作歌曰：乱离既普，殆为灰朽。侥幸之运，赖兹应后。岁寒不凋，孤境独守。拯我涂炭，惠隆丘阜。润同江海，恩犹父母。
有诗叹道：
贤如伯道竟无儿，邵女能军又守嫠。
再看江州悲雾起，茫茫天道果难知？
欲知后来故事，且容作者慢表。