鱼类在水域中的分布呈现出多样化的特点，有的鱼在底层活动，有的鱼在中层穿梭，这种分布差异是由多种因素共同作用所导致的。
首先，鱼类的生理特征是影响其栖息水层的重要因素之一。不同种类的鱼具有不同的体型、鳍的结构和游泳能力。底层鱼类通常具有扁平的身体和适合在底部活动的特殊鳍形，这使得它们能够在水底自如地游动和觅食。例如，鲶鱼和鲤鱼的身体形状有助于它们贴近水底，减少水流的阻力，并能够在复杂的底层环境中寻找食物。相比之下，中层鱼类的身体往往更加流线型，鳍的结构更适合在水的中层保持平衡和快速移动，如草鱼和鳊鱼。它们的身体构造使得它们能够在中层水域有效地追逐猎物或躲避天敌。
鱼类的摄食习性在其水层分布中也起着关键作用。底层鱼类通常以水底的有机物、底栖生物、藻类和碎屑为主要食物来源。它们演化出了适应在底部寻找和摄取食物的特殊口部结构和觅食行为。例如，泥鳅善于在泥底挖掘寻找小型无脊椎动物；黄颡鱼则凭借其特殊的口部结构能够轻易地捕食水底的昆虫幼虫和甲壳类动物。而中层鱼类的食物来源则更多地集中在水层中部的浮游生物、小型鱼虾和植物碎屑等。它们的捕食方式和消化系统也相应地适应了这种食物类型。
水域的环境条件对鱼类的分布有着显着的影响。水深、水温、水流、溶氧量和水质等因素都会决定鱼类选择栖息的水层。在水深方面，较深的水域为中层和底层鱼类提供了更广阔的生存空间。底层通常水温相对较低且稳定，适合一些对温度变化较为敏感的鱼类。例如，在寒冷的季节，许多底层鱼类会选择在较深、水温较稳定的区域栖息。水流对于鱼类的分布也至关重要。在水流较缓的区域，底层鱼类更容易在水底停留和觅食；而在水流较快的水域，中层鱼类可能更容易保持其位置和游动。溶氧量的分布也不均匀，底层水域由于有机物分解和沉积，溶氧量可能相对较低，而中层水域通常能够提供更充足的氧气供应，适合对氧气需求较高的鱼类。水质的清澈度也会影响鱼类的分布。在清澈的水域中，中层鱼类可能更容易发现猎物和躲避天敌；而在浑浊的水域，底层鱼类可以利用水底的掩护更好地隐藏自己。
鱼类的行为和本能也是决定其栖息水层的因素之一。一些鱼类具有明显的领地意识和社交行为，这会影响它们在水域中的分布。例如，一些底层鱼类会在特定的区域建立巢穴或领地，并在那里繁殖和生活。而中层鱼类可能会形成松散的群体，以共同觅食和防御天敌。鱼类的避敌本能也会导致它们选择不同的水层。一些鱼类认为底层的复杂环境能够提供更好的隐藏和保护，而另一些鱼类则相信在中层的快速游动和灵活转向可以躲避天敌的攻击。
季节和气候变化对鱼类的水层分布产生动态的影响。在不同的季节，水温、食物资源和繁殖需求都会发生变化。例如，在春季和夏季，水温升高，浮游生物大量繁殖，中层水域的食物资源丰富，吸引更多的鱼类来到中层觅食。而在秋季和冬季，水温下降，一些鱼类会向底层迁移以寻找更温暖的水域和稳定的环境。气候变化，如暴雨、干旱等，也会改变水域的物理和化学性质，从而导致鱼类调整其栖息的水层。
不同鱼类之间的竞争和共生关系也会影响它们在水域中的分布。在同一水域中，不同种类的鱼可能会竞争相同的食物资源或生存空间。为了减少竞争压力，一些鱼类会选择在不同的水层栖息和觅食。例如，底层的鲫鱼和中层的鲢鱼可能会因为食物偏好和栖息水层的不同而减少直接的竞争。同时，一些鱼类之间也存在共生关系，它们会在不同的水层相互协作，共同生存。比如，底层的虾类和中层的某些鱼类可能会形成一种互利的生态关系，虾类为鱼类提供了部分食物来源，而鱼类的活动又为虾类创造了适宜的生存环境。
此外，水域中的生态系统结构和食物网也对鱼类的分布产生影响。底层水域的生物群落，如底栖藻类、微生物和无脊椎动物，构成了底层鱼类的主要食物基础。中层水域则有着丰富的浮游植物和浮游动物，为中层鱼类提供了充足的能量来源。水域中的植物分布也会影响鱼类的栖息水层。例如，靠近水面的水生植物为一些鱼类提供了产卵和躲避的场所，而水底的水草则为底层鱼类提供了食物和掩护。
鱼类的生长阶段和繁殖需求也会导致其在不同水层活动。幼鱼在成长过程中可能会根据自身的发育和保护需求选择不同的水层。例如，某些鱼类的幼鱼在早期阶段可能会靠近水面，以获取更多的浮游生物作为食物，随着成长逐渐迁移到底层或中层。在繁殖季节，鱼类会根据繁殖习性选择特定的水层。有些鱼类需要在底层的沙石上产卵，而有些则在中层的水草间繁殖。
人类活动对水域环境的改变也间接影响了鱼类的水层分布。例如，过度捕捞可能导致某些鱼类的种群数量减少，从而改变它们在水域中的分布模式。水污染会破坏水域的生态平衡，影响水质和食物资源的分布，迫使鱼类寻找更适宜的生存水层。水利工程的建设，如大坝的修建，改变了水流和水深，也会对鱼类的栖息和分布产生深远的影响。