朱由榔继续说道：“朕已决意废除太祖所定卫所制，使军户尽数转为农户。”言毕，殿堂之内，气氛骤然凝重。
李定国虽有所察觉，亦觉得朱由榔此举甚是大胆，他已经能想朝廷里那些老臣因为陛下擅改祖制而痛心疾首的样子。
朱由榔倒没有觉得任何不妥，继而阐述其深思熟虑之策。
“太祖设立卫所，旨在巩固国防，安抚军心。然而，岁月流转，此制已暴露诸多不足。军户世代受制，身不由己，家世束缚，长此以往，士气难以提振，战斗力亦难提升。今朕意欲打破此锁链，赋予军户自由选择人生道路之权，或耕作于田野，或投身工商，各尽其才，各得其所。”
听到这里，李定国不禁点头，他深感朱由榔所言极有道理。他沉思片刻，说道：“陛下英明，此举非但可解军户之困，更能增强国力，安抚民心。军户转为农户，不仅能增加粮食产出，改善民生，亦为国家培养了潜在的后备兵源。一旦国家有需，这些受过训练的军户子弟，必将迅速集结，响应王师。”
朱由榔听罢，面露悦色，对李定国之支持心怀感激：“兄长所言极是，朕亦有此意。此外，朕还计划对现有军制进行改革。”
大明朝的军制错综复杂，主要由京军、边军和地方驻军构成。
京军由京营和亲军组成，京营乃京师防御及主要机动之师，洪武年间设有四十八卫，兵力二十余万，后增至七十二卫，兵力达三十余万。京营亦称“五军”，由五军都督府统领。京军中亦包括侍卫亲军，如锦衣卫等，专责皇帝侍卫及皇城守卫。
边军则主要承担边疆防御之责，构成大明防御体系之关键。边军规模与京军相匹，驻守各要塞，抵御外敌。
地方驻军负责各地守备治安，由各卫所组成。
卫所军及官位世袭，然五军都督府官及都司则不世袭，为流官。
卫所军及官属军籍，携家带口，世代定居一地，鲜有变动。
朱由榔将一本奏章递给李定国，说道：“此乃兵部所拟改制方略，请兄长一观。”
李定国接过奏章后，目光如炬，一页页翻阅着，眉头时而紧蹙，时而舒展，显然在深思。
其改革为:
其一、改军户制为募兵制，凡年满十八岁以上青年，身高五尺以上，不分户籍，体力身负三十斤重物，在三炷香内跑完三十里者为考核合格。
其二、募兵不再自备甲胄、弓弩、刀枪等装备及粮食。由朝廷负责统一标准武器制作，并集中管理保证武库武器的维护和充足。粮草由朝廷统一发放。
近期朱由榔让户部研究罐头，用于保存肉食和蔬果。得益于炼铁技术的提升和蒸汽机的应用，用于进行包装的铁皮盒已经制作出样品，现在主要的技术问题在于如何制作成真空。
其三、将原有卫所制下都指挥使司、指挥使、正千户、副千户、所镇抚、百户、总旗、小旗及营伍制下总督军务威武大将军总兵官、都督、总督、提督等这些官职统统取消，改为军、师、曲、营、队、什六级。
什是最小的战斗单位，由十名士兵组成，设什长、什副各一名，由队部提名，报营部批准。
队由十个班组成，人数为一百人，设队长、队副各一名，由营部提名，报曲部批准。
营由五个排组成，人数为五百人，设营长一名、营副一名、营参谋一名，由曲部提名，报师部批准。
曲由五个营组成，人数为二千五百人，设曲长一名、曲副一名、曲参谋一名，由师部提名，报军部批准。
师由四个曲组成，人数约为一万人，设师长一名、师副一名、师参谋一名，由皇帝任命。
军由二到五个师组成，人数在两万到五万人之间，设军长一名、军副一名、军参谋一名，由皇帝任命。
军以上为集团军，由两个以上军组成，指挥官为司令，由皇帝指定。
最高军事指挥为皇帝。
根据需要还可设立独立师、独立团等单位，不入编制，为临时部队。
其四、制定军衔制度，分为八等二十级，主要是明确将士的待遇。
最高军衔为统帅，对应皇帝。
司令对应元帅，每月饷银四百两。
军级对应上将、中将、少将，饷银分别为二百两、一百八十两、一百六十两。
师级对应上校、中校、少校，饷银分别为一百两、九十两、八十两。
曲级对应上尉、中尉、少尉，饷银分别为五十两、四十五两、四十两。
营级对应一级准尉、二级准尉、三级准尉，饷银分别为三十两、二十五两、二十两。
队级对应上士、中士、下士，饷银分别为十两、八两、六两。
什级对应一等兵、二等兵、列兵，饷银分别为三两、二两五钱、二两。
其五、取消京军、边军和地方驻军之分，改设战区。全国设东南西北中五大战区，其中西部战区覆盖西南三省，其余战区暂时不表。皇帝是最高军事指挥，战区设司令一员，指挥一个或几个军，由皇帝直接分配，主司战斗之责。地方不设军队，维护治安之责，由各地巡检司负责。
其六、加强军队思想教育，每个营设一个宣教部，每个排派一名宣教员，专门负责士兵的日常思想教育工作。
其七、实行预备役制度，参照正规军制度，亦设置六级，每省设一军，每府根据人数设一至五师，每县根据人数设一至五曲。所有十八岁至四十岁的百姓均定期参加军事训练，熟悉基本的行伍指令，掌握火枪火炮的使用方法，平时以县为单位，每年进行夏训、冬训两次集训，每次集训不少于十五日。一旦需要，就能快速拉出一支能战斗的队伍。
李定国心中一震，他早有预感陛下将有大动作，却未料到竟是如此彻底的变革。他心中既感忧虑，又生敬佩，复杂情绪交织于胸。
朱由榔直接言明：“兵者当殉国忘身，舍生取义。强军之路，非患兵寡，患不精也。军制冗杂，纪律废弛，何来百战雄师？”