林爽文派起义军队伍一千多人护送自己的家眷，护送车辆缘山梁行走，林爽文派部下蒋上国负责指挥，他骑着马，拿着旗子，来来回回的指挥朱护送队伍前行。
此时的清军队伍在海兰察的率领下，绕着山峰攀援而上，海兰察一边进攻，一边射箭。起义军护送队伍和清军的交火中，蒋光国不幸中箭受伤，被清军擒获。
蒋光国被清军擒获后，起义军护送林爽文家眷的队伍乱了阵脚，护送车辆的牛马受到惊吓，狂奔乱跑，车上的家眷被摔落下来，惊恐之中，自相践踏，死伤无数。
清军主力开始直攻林爽文的大本营大里杙。大里杙作为林爽文的大本营，防守严密，戒备森严。再加上它本身的优越地理位置，东依大山，南靠溪河，易守难攻。
林爽文自信满满，认为清军绝对攻不下大里杙。
林爽文为了防止清军的围攻，在大里杙设置了许多屏障和陷阱。他在大里杙砌筑土城，密设大炮，四周又扎了两道栅栏，城外还挖有沟渠，而且沟渠重叠，防守森严。
福康安率领清军到达大里杙的时候，天色已近黄昏。
福安康根据海兰察的建议，把部队分成两部分，一部分由海兰察率领，暗伏在大里杙外面的沟渠间，另一部分由一员大将率领，到大里杙门前喊叫，挑衅。
林爽文的队伍看见清军前来挑衅，就派出一支人马前去迎战。
清军假装战败，渐战渐退，他们把林爽文的起义军引到他们的伏击圈内。
海兰察一声令下，暗藏在沟渠间的清军一起发铳射箭，枪弹密集如雨，把林爽文的起义军打了个措手不及。
林爽文的部队突然遭到暗处敌人袭击，一时不知所措，乱了阵脚。再加上林爽文的起义军在明处，清军在暗处，以暗攻明，百发百中，起义军死伤无数。
很快，起义军就乱了方阵，此时海兰察见时机已经成熟，就大喊一声：“冲啊！”然后跃马上前，率先士卒，冲入林爽文的起义军队伍。
其他人看着海兰察跃马进入起义军阵营，也紧跟着海兰察冲向林爽文的起义军。
经过双方几个时辰的激烈交战，最终林爽文起义军终因寡不敌众，被清军打败，大里杙被清军攻克。
大里杙被清军攻克后，福康安下令兵丁把大里杙夷为平地，焚烧房屋，把大里杙的谷物散发给义民作为口粮，把抢来的衣物和牛羊赏赐给自己的兵丁。
林爽文轰轰烈烈的起义就这样在福康安和海兰察的打击和镇压下失败了。
林爽文见清军长驱直入，声势浩大，自知起义军大势已去，难以抵挡，就携带家眷逃往集集埔。
集集埔也是一个地势险要的地方，它处在两山之中，林爽文阻溪守御，他还在断崖处垒砌石墙，堵塞交通。
林爽文把集集埔作为起义军的最后一站，决定在这儿和清军决一死战，要么你死，要么我亡。
福康安也不示弱，他决定在这儿彻底剿灭林爽文的起义军。他命令士兵大炮轰击集集埔，林爽文同样以大炮还击，双方交战处于交织状态。
一时间，山山上下，到处都是擂鼓声、枪炮声、喊叫声、交战声，双方相持不下。
海兰察发现这也不是取胜的办法，他就改变了策略，悄悄带着数十名巴图鲁、侍卫冒着炮火，骑着战马渡过溪水，攀援上山，率领众人从集集埔后面攻击林爽文起义军。
海兰察进入集集埔后面，突然出现在起义军的腹背。他们推倒林爽文砌筑的石墙，砸坏他们围扎的栅栏，道路哗然大开。憋足了劲的清兵挥舞着大刀冲向林爽文的起义军，逢人就砍杀。
喘息未定的起义军还没有来得及休整，早已精疲力尽，毫无斗志，现在又突然遭到海兰察的袭击，一时无所是存，只能拼命还击。
只见黑暗中，刀光剑影，火花四溅，喊杀声、叫喊声、马蹄声交织在一起，在黑暗的夜里响彻云霄。
林爽文的起义军勉强支撑了一袋烟的功夫，便被清军打得溃不成军，开始四处逃窜。
很快，集集埔被清军占领，林爽文只好率领不足一百人的起义军遁入重叠的大山中，隐藏起来。
福康安和海兰察立即调兵遣将，封锁海陆路口，派将士对林爽文起义军逃入的大山进行地毯式搜索。
他们一天天不断缩小包围圈，最终，在乾隆五十三年正月初五，林爽文被清军抓获。
林爽文被抓获后，起义军只剩庄大田余部。福康安和海兰察又分兵两路，进攻庄大田部。
此时的起义军大势已去，只有招架之功，而无还手之力。很快，庄大田率领的起义军也因寡不敌众，被清军打散。
庄大田只好带着几个亲信隐匿于深山老林中，不久他也被清军抓获。
起义军首领林爽文、庄大田被清军抓获后，按照清廷律令，林爽文、庄大田等起义军领袖人物，将被押赴京城，凌迟处死。
乾隆五十三年三月初十，起义军首领林爽文、庄大田等人在经历了三千六百刀的酷刑后，被割下头颅，挂在茶市场口枭示。
菜市口刑场的上空，高高地悬挂着一个个起义军首领的头颅，头颅上滴下点点血迹，菜市场周围的空气中弥漫着一股血腥味，久久不能散去。
京城里的老百姓从菜市口走过的时候，仿佛看见一个个冤屈的灵魂在跟着他们，一双双冤屈的眼睛在看着他们，令他们毛骨悚然。
高高地挂在菜市场门口上的一个个头颅，宣示着一场战争的结束，宣示着一场胜利者对失败者杀戮的惩罚。
起义军就这样结束了，他的首领林爽文这位未到而立之年的会党领袖终于败在了年近八旬的乾隆皇帝手里。
战争结束了，失败者付出的是生命的代价，而胜利者付出了比失败者更大的代价，胜利者不光付出的是无数士兵的生命，还有劳民伤财的数百万两白银军饷和无数石的粮食。
挂在菜市场门口枭示的人头已经变成了骷髅，看似风平浪静的社会表面却暗流涌动，潜伏在各地的秘密社会组织依然存在。
屡遭镇压的白莲教首领，也在秘密收徒、传教，酝酿着一次新的更大规模的社会动荡。